内镜中心是内蒙古自治区人民医院作为大型综合医院发展重点打造的特色专科平台，是香港威尔斯亲王医院内镜中心（亚太内镜培训基地）的共建中心，内设香港中文大学校长沈祖尧院士消化系统疾病院士专家工作站，参与亚洲及泛太平洋地区15国多中心大肠癌筛查及风险评分评估项目。
   中心建筑面积1500平方米，各功能区布局及诊疗流程合理，环境温馨、舒适，同时充分考虑保护就诊者隐私。中心拥有国内外先进设备资产总值超过3000万元，拥有Olympus最新全系列消化道电子内窥镜主机6套，配备高清晰电子胃镜、电子肠镜、经鼻电子胃镜、电子放大胃肠镜、电子十二指肠镜共40余条，配备电凝电切设备和氩离子凝固电切设备(氩气刀)共3台，拥有先进的信息网络系统，包括叫号、监控、教学及转播等功能，可以进行远程教学、转播工作。为更好地开展消化道内镜的介入诊疗工作，在自治区内率先引进了美国GE公司生产的中型C型臂X光机，既提高诊疗技术水平，且极大降低手术过程中放射线对患者及医护人员伤害的风险。中心拥有一体智能化的先进消化内镜清洗消毒系统及自动洗消机系统，严格执行国家技术规范清洗消毒消化内镜，有效地杜绝内镜诊疗过程中交叉感染的风险，确保医疗安全。配备麻醉复苏监测系统，保障术中及术后复苏安全性。
    中心现有医护人员14名，其中主任医师2名、医师2名,主任护师1名、副主任护师1名、主管护师6名、护师2名；还有兼职医生11名，消化内科医生8名，消化外科医生3名；所有医护人员均经过专业的内镜技术培训，取得技术操作准入资格，中心施行手术分级管理制度和准入制度。内镜中心作为专科平台与全院消化内外科医生密切合作并提供更多的技术支持与服务。

中心开展的消化道早期癌及癌前病变的内镜诊疗技术到达国内先进水平，内镜下粘膜剥离术（ESD）及隧道技术（STER）、逆行性胰胆管造影术(ERCP)及其相关治疗技术、内镜超声诊断治疗技术（EUS+FNA）的开展标志我院内镜中心诊疗技术的日趋成熟与完善。